水牛CART基因的克隆测序及蛋白质结构与功能预测
文献类型: 中文期刊
作者: 于农淇;鄢胜飞;覃广胜;尚江华;郑海英;杨春艳
作者机构:
关键词: CART;水牛;蛋白质功能预测
期刊名称:畜牧与兽医
ISSN: 0529-5130
年卷期: 2020 年 NULL 卷 2 期
页码: 1-6
摘要: 为探讨水牛可卡因-苯丙胺调节转录肽(cocaine-and amphetamine-regulated transcript, CART)基因功能,以水牛卵巢组织RNA转录的cDNA为模板,参考GenBank预测的水牛CART基因组序列设计引物,采用PCR和在线生信分析软件对CART基因进行克隆和蛋白质结构预测分析.结果显示:水牛CART基因CDS区全序列长为351 bp,编码116个氨基酸;对所得核酸序列和蛋白质结构分析预测显示,水牛CART基因与美洲野牛、野牦牛、普通牛、羊、双峰驼、单峰驼、野猪、马、非洲野驴、人类及猕猴相似程度分别为100%、98%、100%、98%、91%、91%、78%、85%、85%、81%、90%;Mega分析显示在多胃反刍动物间有较高同源性;蛋白质结构预测显示,CART蛋白含有N端信号肽,是分泌蛋白,功能与神经、辅酶和离子结合相关.
分类号: S823.83
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