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马铃薯A病毒在云南省的发生及其P3蛋白序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杜霞;吴阔;苏晓霞;张丽珍;刘霞;高玉林;张仲凯;杨艳丽;董家红

作者机构:

关键词: 马铃薯A病毒;云南省;马铃薯;P3;序列分析

期刊名称:西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2020 年 NULL 卷 3 期

页码: 516-523

收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2020-2021年度) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)

摘要: [目的]了解马铃薯A病毒在云南省的发生分布情况,明确云南省分离物变异情况.[方法]用DAS-ELSIA的方法,检测云南省19个种植马铃薯县(市)的389个样品;对5个地区的阳性样品用RT-PCR扩增马铃薯A病毒P3蛋白基因,克隆测序,使用DNAMAN及DNAStar等软件分析序列,采用MEGA 6.0邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建系统进化树.[结果]DAS-ELISA检测389个样品,PVA的检出率为20.82%.用P3蛋白基因特异性引物从云南5个不同地区的PVA阳性样品中扩增得到1041bp的目的片段;比较分析了云南省5个地区马铃薯A病毒分离物之间,及与国内外13个分离物的P3蛋白和PIPO蛋白同源性,发现云南省5个地区PVA分离物之间P3蛋白和PIPO蛋白氨基酸序列同源性分别为98.8%~99.7%和97.6%~100.0%;与国内外13个分离物P3蛋白和PIPO蛋白的氨基酸序列同源性分别为90.8%~99.1%和90.5%~100.0%.系统进化树显示,云南省5个分离物与湖南省分离物(KF977085)亲缘关系最近;PVA马铃薯分离物和新西兰树番茄分离物之间亲缘关系较远.[结论]PVA在云南省发生普遍;云南省马铃薯A病毒存在一定程度的变异;PVA存在一定的寄主适应性.

分类号: S435.32

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