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貉源阿留申病毒VP2和NS1蛋白的抗原性预测

文献类型: 中文期刊

作者: 吴艳虹;赵永强;韦韬;章秀婷;丛丽;岳志刚;肖家美;邵西群

作者机构:

关键词: 阿留申病毒;VP2蛋白;NS1蛋白;抗原表位;翻译后修饰位点

期刊名称:畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2020 年 NULL 卷 6 期

页码: 1399-1407

收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2020-2021年度) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)

摘要: 旨在预测和分析貉源阿留申病毒(RFAV)VP2和NS1蛋白的抗原表位特征,筛选阿留申病毒属较保守的B、T细胞抗原表位.本研究对RFAV的近全长基因组进行克隆及测序,对其VP2和NS1基因编码蛋白的理化性质、二级结构、翻译后修饰位点和抗原表位进行预测,并将预测的修饰位点、抗原表位与其他阿留申病毒种的序列进行比较分析,筛选相对保守的修饰位点和抗原表位.结果显示,获得的RFAV基因组长4 327 bp,编码VP2蛋白的636个氨基酸,编码NS1蛋白的641个氨基酸.VP2和NS1蛋白均为亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主.在阿留申病毒属内,VP2蛋白有3个保守的B细胞抗原表位,3个保守的T细胞表位,8个保守的翻译后修饰位点;NS1蛋白有1个保守的B细胞抗原表位,2个保守的T细胞抗原表位和7个保守的翻译后修饰位点.本研究成功克隆了RFAV近全长基因组序列,全面对RFAV的VP2、NS1蛋白抗原表位、翻译后修饰位点进行预测,并分析其在阿留申病毒属内的保守和变异特征,为阿留申病毒免疫研究提供参考.

分类号: S852.4

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