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枯草芽孢杆菌YX-1胞外多糖转运基因(EpsK)的克隆和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周帆;邵财;丁冠中;梁池嘉;穆朋;张悦;王岩;郑毅东;王海涛;刘宁

作者机构：

关键词： Bacillus subtilis YX1;EpsK;胞外多糖;生物信息学分析

期刊名称：特产研究

ISSN： 1001-4721

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 生物膜的形成是许多细菌在根系定殖和与植物发生有益互作的前提和关键，胞外多糖（exopolysaccharides， EPS）是生物膜的重要组成部分，其生物合成和分泌受Eps基因簇调控，其中EpsK涉及EPS的转运。本研究对枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis YX1）中EpsK进行克隆，利用生物信息学方法对其进行分析。结果表明，菌株YX1中EpsK基因长1 518 bp，编码505 个氨基酸，相对分子量为54.9337 kD，等电点9.86；EpsK蛋白与Bacillus subtilis subsp. spizizenii中MATE家族转运蛋白同源性达100%，8～483位氨基酸为跨膜螺旋，存在信号肽，包含13个磷酸化位点；Eps K蛋白的三级结构包含α-螺旋，β-折叠和β-转角，与二级结构序列特征分析基本一致，表明菌株YX-1中的EpsK可能在EPS转运过程中发挥重要作用。本研究为进一步深入解析枯草芽孢杆菌中EPS转运机制提供了理论基础，有助于推动药用植物栽培产业的健康发展。

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