湖羊m6A甲基转移酶METTL14基因CDS序列克隆及表达谱分析
文献类型: 中文期刊
作者: 张丹;陈博雯;杨博辉;刘建斌;卢曾奎
作者机构:
关键词: 湖羊;METTL14基因;生物信息学分析;组织表达谱
期刊名称:南方农业学报
ISSN: 2095-1191
年卷期: 2023 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 【目的】克隆湖羊METTL14(Methyltransferase-like protein 14)基因的编码区(CDS)序列,探究其分子特征及组织表达规律。【方法】提取湖羊肌肉组织RNA,通过反转录获取cDNA,以cDNA为模板,克隆获得METTL14的CDS区,进行生物信息学分析,利用qRT-PCR构建METTL14组织表达谱。【结果】湖羊METTL14基因CDS区全长1371 bp,该区域编码456个氨基酸;湖羊与山羊血缘关系最近,与双峰驼最远;编码的蛋白预测等电点为5.89,属于不稳定蛋白质,表现出较强亲水性;METTL14无信号肽与跨膜区域,亚细胞定位预测显示其主要分布在细胞核内(69.60%);METTL14蛋白质包括12个螺旋和10个折叠,其三级结构主要由无规则卷曲、螺旋和折叠组成。METTL14在湖羊9个组织中均有表达,相比于皮下脂肪中的表达量,心脏中表达量最高(P<0.01),肝脏中表达量最低(P<0.01)。【结论】湖羊METTL14基因编码蛋白是一个酸性不稳定蛋白,主要定位在细胞核中,且在心脏和骨骼肌中均有表达,进一步为METTL14基因在湖羊肌肉发育的调控机制的研究奠定理论基础。
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