帕米尔牦牛CXCL17基因克隆及组织表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 马超凡;王佟;郑青波;邓婧瑛;于沁冉;周瑞;孔思远;包鹏甲;阎萍
作者机构:
关键词: 帕米尔牦牛;CXCL17基因;基因克隆;组织表达
期刊名称:中国草食动物科学
ISSN: 2095-3887
年卷期: 2024 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: CXC族趋化因子配体17(CXCL17)是一种新型的趋化因子,其主要在黏膜组织表达,对于维持黏膜屏障的稳态具有功能性作用,包括调节免疫细胞招募、血管生成和微生物控制。目前对牦牛CXCL17基因的研究甚少,本探究以帕米尔牦牛肺脏组织作为cDNA材料,通过PCR技术克隆CXCL17基因的编码区序列(CDS区),然后对其进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR技术分析该基因在睾丸、肝脏、肺脏、脾脏、胰腺、皱胃、盲肠、瘤胃、十二指肠以及背腰最长肌等不同组织中的表达规律。结果显示:帕米尔牦牛CXCL17基因CDS区全长357 bp,共编码118个氨基酸;帕米尔牦牛CXCL17蛋白质序列与野牦牛的同源性达100.0%,其次与黄牛的相似性达98.3%;与帕米尔牦牛亲缘关系最近的是野牦牛,其次是黄牛和瘤牛;CXCL17蛋白存在信号肽,并属于亲水性蛋白质;CXCL17蛋白高级结构主要由α-螺旋(43.22%)、无规则卷曲(46.61%)以及β-折叠(10.17%)构成;CXCL17蛋白质与CCL28、CCL25、CXCL10、CXCL14和CCL26共5个蛋白质存在互作关系;CXCL17基因在帕米尔牦牛皱胃中的表达量最高,其次为肺脏,二者极显著高于其他组织(P<0.01),表达量最低的是睾丸。本试验成功克隆了CXCL17基因完整的CDS区,并发现其在帕米尔牦牛皱胃与肺脏中具有相对高的表达特性。
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