数字农科院2.0

地熊蜂基因组中具有潜在活性的转座子鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 王全贵;孙成

作者机构：

关键词： 转座子;熊蜂;基因组;基因挖掘

期刊名称：中国蜂业

ISSN： 0412-4367

年卷期： 2021 年 72.0 卷 5.0 期

页码：

收录情况： 院主办刊

摘要： 转座因子(TEs)是真核生物基因组的主要序列成分,对真核生物基因组的结构、功能及进化具有重大影响.近年来,虽然有关昆虫转座子的研究在不断增加,并且科学家成功地应用转座子进行了功能基因的挖掘,但相关研究主要集中于双翅目的果蝇中.本研究利用生物信息学方法,基于de novo预测和结构预测两种策略,对地熊蜂参考基因组中的转座子进行了详细鉴定、分类和注释,并鉴定出潜在活跃的转座子.结果 显示:虽然转座子序列仅占地熊蜂基因组全部序列的3.74％,但其超家族种类繁多,鉴定出的33282个转座子分属于22个超家族.本研究鉴定出2种具有潜在活性的MITE转座子,它们很可能正在地熊蜂基因组中发生转座.本研究为利用活跃的转座子创制地熊蜂的突变体库进而挖掘熊蜂的功能基因奠定了重要基础.

分类号：

  • 相关文献

[1]Chromosome-level genome of a multivoltine biotype Ostrinia furnacalis strain. Liu, Kaiqiang,Zhang, Tiantao,Zhang, Yongjun,Wang, Zhenying,He, Kanglai. 2025

[2]棉花纤维品质相关基因挖掘及功能基因研究进展. 肖水平,宋国立,余进祥. 2020

[3]水稻种质资源的分子鉴定和育种利用. 叶卫军,胡时开,李媛媛,马伯军,郭龙彪. 2013

[4]棉花抗旱耐盐转基因材料鉴定及其外源抗性基因的挖掘. 王俊娟,王德龙,阴祖军,樊伟丽,王帅. 2015

[5]大豆分子育种研究新进展. 曲梦楠,蒋炳军,刘薇,毛婷婷,马立明,林抗雪,韩天富. 2014

[6]植物叶色突变分子机制的研究进展. 杜文凯,袁素霞,胡凤荣. 2019

[7]转录组数据分析与功能基因挖掘. 李欣,李小俊,陈晓丽,赵毅强,王栋. 2019

[8]大豆分子育种研究进展. 蒋炳军,岳岩磊,王彩洁,孙石,韩粉霞,韩天富. 2012

[9]烟草品质性状相关基因挖掘与功能解析研究进展. 陈帅,任民,杨爱国. 2023

[10]基于F2和RIL群体鉴定棉花抗黄萎病主效QTL. 赵云雷,王文菊,陈伟,王海红,朱喜霞,杨继华,鲁宁宁,赵佩,桑晓慧,崔艳利,敦磊,王红梅. 2023

[11]水稻中胚轴研究进展. 任宁宁,孙永建,申聪聪,朱双兵,李慧菊,张志远,陈凯. 2024

[12]水稻稻瘟病抗性基因挖掘与利用研究进展. 杨婕,杨长登,曾宇翔,侯雨萱,陈天晓,梁燕. 2024

[13]栽培大豆中黄13响应强光的转录组分析. 张玲阁,杨菁菁,高莹莹,张兴坦. 2024

[14]2023年小麦新基因挖掘和遗传改良新技术研究回眸. 叶兴国,林志珊,王轲,唐华丽,韩志阳. 2024

[15]小麦耐盐基因挖掘和种质鉴定及创制研究. 赵补全 ,,要星宇,,叶兴国,,唐华丽,,张双喜. 2025

[16]西瓜核心种质耐盐性的全基因组关联分析. 袁高鹏,赵彦龙,孙德玺,高博文,李卫华,时明坤,张靖宇,朱迎春. 2024

[17]棉铃虫膨胀线粒体基因组的鉴定与分析. 张屾,谷少华,李显春. 2019

[18]转座子标签法克隆水稻基因前景. 朱正歌,孙宗修. 2001

[19]水稻转座子突变体库的构建及突变类型的遗传分析. 朱正歌,肖晗,傅亚萍,胡国成,于永红,斯华敏,张景六,孙宗修. 2001

[20]无筛选标记转基因作物的硏究进展. 陈扬勋,张治国,路铁刚. 2012

作者其他论文 更多>>