芥菜NHX基因家族成员鉴定及其在盐胁迫下的表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 许思文;王海平;宋江萍;张晓辉;贾会霞;徐云敏;文熙宸;王师敏;廖俊波;冷雪娇;阳文龙
作者机构:
关键词: 芥菜;Na+/H+逆向转运蛋白基因;盐胁迫;表达分析
期刊名称:生物工程学报
ISSN: 1000-3061
年卷期: 2025 年
页码:
收录情况: EI(2025版) ; ; 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版)
摘要: NHX基因编码Na+/H+转运蛋白,属于阳离子/质子逆向转运体(cation/protonantiporter,CPA),在植物生长发育和非生物胁迫应答中发挥重要作用。为研究芥菜NHX基因家族成员及其与耐盐性的关系,本研究利用生物信息学分析,在全基因组范围内对芥菜NHX 基因家族成员进行了鉴定,并对其基因结构、保守基序、进化关系、启动子顺式作用元件及盐胁迫下基因的表达模式进行了分析。结果表明,芥菜基因组中共鉴定出18个BjuNHXs基因,这些基因编码的蛋白质均为疏水性蛋白,氨基酸残基数为451-1 140 aa,相对分子量为50 308.78-125 811.24 Da,理论等电点在5.25-7.71之间;蛋白质二级结构均包括α-螺旋、延伸链、β-转角以及随机卷曲。18个BjuNHXs外显子数量在13-23个之间,鉴定的10个motif结构中每个基因都含有motif4和motif5。NHX基因家族可分为3个亚族,不均匀分布在11条染色体上。启动子顺式作用元件分析结果表明NHX基因家族含有对光、植物激素和非生物胁迫做出反应的不同元件。实时荧光定量PCR (real-time fluorescence quantitative PCR, qRT-PCR)分析结果发现芥菜BjuNHX07和BjuNHX09基因均随着盐处理时间的增加呈现持续上升表达模式,BjuNHX12、BjuNHX17在耐盐材料‘A800’中的表达量显著高于敏盐材料‘A297’。这些结果为芥菜NHX基因的深入研究和芥菜耐盐品种的选育奠定了重要基础。
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