斧翅沙芥花药不同发育时期转录组分析
文献类型: 中文期刊
作者: 秦鑫愿;张晓辉;杨忠仁;黄修梅;张凤兰;张晓艳;常小瑶;张彤
作者机构:
关键词: 斧翅沙芥(Pugionium dolabratum);花药发育;转录组;差异基因表达
期刊名称:分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2025 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: 本研究以不同发育时期的斧翅沙芥花药为材料,通过高通量测序分析差异基因,为斧翅沙芥花药发育分子研究提供理论依据。结果显示,转录组共组装到43 715个unigene,其中四分体与成熟期的差异基因数目最多,上调基因和下调基因数目分别为5 928和5 353。GO和KEGG分析表明,斧翅沙芥花药发育差异基因主要参与淀粉和蔗糖代谢、类黄酮代谢和苯丙烷生物合成等,并在三个发育时期共同注释到苯丙烷生物合成、玉米素生物合成以及类胡萝卜素生物合成代谢途径。分析了苯丙烷生物合成途径的相关差异基因的表达模式,共筛到55个差异基因。从转录组数据中随机选取8个差异基因进行RT-qPCR验证,验证结果与转录组数据基本一致,表明数据真实可靠。本研究为进一步研究斧翅沙芥不同时期花药发育的分子机制奠定了基础。
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