数字农科院2.0

基于GBLUP等模型对梅花鹿(Cervus Nippon)生长相关性状基因组选择的预测准确性比较

文献类型: 中文期刊

作者: 李浩东;闵祥玉;周雅;张禾垟;郑军军;刘琳玲;王平;王艳梅;杨福合;王桂武

作者机构:

关键词: 梅花鹿;生长相关性状;遗传力;基因组选择;准确性

期刊名称:畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2022 年

页码:

收录情况: 北大核心(2020版) ; ; CSCD(2021-2022年度) ; ; 科技核心(2021版) ; ; 农林核心(2020版)

摘要: 旨在基于GBLUP等模型对梅花鹿(Cervus Nippon)生长相关性状基因组选择的预测准确性进行比较。本研究以吉林某鹿场2014-2019年所产梅花鹿261只作为研究群体(公鹿96只,母鹿165只),首次对梅花鹿体重体尺等生长相关性状进行了遗传力估计,并基于5-fold交叉验证方法对GBLUP、Bayes A、Bayes B、 Bayes C、Bayes Lasso、RRBLUP六种基因组选择模型预测准确度进行了比较,以筛选出适合梅花鹿生长相关性状的基因组选择模型。结果发现:1)管围与臀端高的遗传力分别为0.43、0.50,属于高遗传力;体重、体高与体斜长的遗传力分别为0.22、0.30、0.27,属于中等遗传力;而胸围的遗传力为0.15,属于低遗传力;2)在GBLUP中,基因组选择预测的准确度与性状的遗传力呈正相关关系,而在Bayes类与RRBLUP法中并未表现明显正相关关系;3)在样本量较少的情况下,选取GBLUP作为基因组选择模型具有一定的优势;Bayes A可在低遗传力性状中作为首选;体重、体高、体斜长、管围、胸围、臀端高预测准确度最高的分别为GBLUP、Bayes B、Bayes C、Bayes B、Bayes A、RRBLUP。在实际生产中,没有能够完全适应所有性状模型,必须根据预测的准确性以及预测的时效性来特异的选择最佳模型。

分类号:

  • 相关文献

[1]快速型黄羽肉鸡饲料利用效率性状的基因组选择研究. 李森,杜永旺,文杰,黄超,陈智武,赵桂苹,郑麦青. 2021

[2]VITEK2 Compact全自动微生物分析系统对牛乳中葡萄球菌的鉴定效果评价. 林杰,张景艳,王磊,王海瑞,邹璐,朱永刚,边亚彬,李建喜,杨志强,王旭荣. 2016

[3]苹果和梨不同品种及品质特性对近红外反射光谱无损测定SSC的影响. 杜艳民,王文辉,贾晓辉,王志华,佟伟,张志云. 2014

[4]VITEK2Compact全自动微生物分析系统对牛乳中葡萄球菌的鉴定效果评价. 林杰,张景艳,王磊,王海瑞,邹璐,朱永刚,边亚彬,李建喜,杨志强,王旭荣. 2016

[5]西门塔尔牛饱和脂肪酸含量的低密度芯片基因组预测. 齐欣,张静静,樊惠中,李娟,胡鑫,刘飞,朱波,高雪,陈燕. 2016

[6]畜禽基因组选择中贝叶斯方法及其参数优化策略. 朱波,王延晖,牛红,陈燕,张路培,高会江,高雪,李俊雅,孙少华. 2014

[7]新西兰苹果品种及砧木育种成就与对中国的启示. 张恒涛,BUSVincent G·M·,WHITEAllan G·,阎振立,过国南,张瑞萍,刘珍珍,YAO Jia-long,CHAGNé David. 2016

[8]燕麦分子育种研究进展. 吴斌,郑殿升,严威凯,申状状,晏林,张宗文. 2019

[9]基因组选择在羊育种中的应用研究进展. 张统雨,魏霞,张勤,杜立新,王立贤,赵福平. 2018

[10]新西兰苹果品种及苹果砧木育种成就与启示. 张恒涛,BUSVincentG.M.,WHITEAllan,阎振立,过国南,张瑞萍,刘珍珍,YAOJia-long,CHAGNéDavid. 2016

[11]肉鸡种业技术发展趋势. 赵桂苹. 2021

[12]中国肉牛种业整体发展现状与趋势. 高雪. 2021

[13]机器学习在动物基因组选择中的研究进展. 李棉燕,王立贤,赵福平. 2023

[14]基于基因组和系谱信息的不同选配方案效果模拟研究. 张鹏飞,何俊,王立贤,赵福平. 2022

[15]金陵花鸡基因组选择效果分析. 杜永旺,黄超,王一东,蔡日春,余洋,赵桂苹,郑麦青. 2023

[16]基因组选择及其在羊育种中的应用研究进展. 李诚兰,郭婷婷,岳耀敬. 2023

[17]梅花鹿育种技术研究进展与展望. 周雅,张禾垟,郑军军,刘琳玲,李浩东,王桂武. 2022

[18]机器学习在畜禽基因组选择中的应用进展. 王进部,李佳,任德明,王立贤,王立刚. 2024

[19]和牛综合选择指数与育种应用研究进展. 王雅漩,周靖航,李义书,侯冠彧,胡俊伟,王瑨,朱波,陈燕,郑彩宏,徐凌洋,高雪,高会江,李俊雅,王泽昭,张路培. 2025

[20]基因组选择在反刍动物中的应用与研究进展. 王海锋,李诚兰,岳耀敬. 2024

作者其他论文 更多>>