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京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王永丽;刘晓静;崔焕先;文杰

作者机构：

关键词： 京星黄鸡;选择信号;功能分析;候选基因;肌内脂肪

期刊名称：中国家禽

ISSN： 1004-6364

年卷期： 2022 年

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收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为研究京星黄鸡肌内脂肪（Intramuscular fat,IMF）性状的遗传基础，研究选用十六世代IMF选择系（n=252）和对照系（n=264）群体，使用XP-EHH和ΔCLR方法分析两个群体基因组选择信号分布情况，挖掘与京星黄鸡IMF性状相关的基因。结果显示：选择系IMF、甘油三酯（Triglyceride,TG）、活重、屠体重等指标均显著高于对照系；XP-EHH与ΔCLR分别注释到678和1 099个基因，共同筛选到264个候选基因，这些基因与脂代谢、生长发育、神经发育等生物学过程有关，并鉴定到ACSL3、ACSL4、GPX1、IRS4、MAPK8、PLA2G4A、PTGS2、MGLL和PLCB1等9个脂代谢关键候选基因。研究表明，IMF含量的表型选择引起了基因组水平变化，鉴定到9个脂肪代谢关键基因，并发现一些可能与生长和神经发育等相关的基因，为IMF遗传基础研究提供参考。

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