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湖羊m6A甲基转移酶基因METTL3的克隆及组织表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈博雯;张丹;刘建斌;杨博辉;卢曾奎

作者机构:

关键词: 湖羊;METTL3基因;生物信息学分析;组织表达谱

期刊名称:基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2023 年

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收录情况: 北大核心(2020版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2023版)

摘要: 本研究对湖羊(Ovis aries)m6A甲基转移酶基因METTL3进行克隆和生物信息学分析,以探究其分子特征和时空表达变化规律。以湖羊肌肉组织cDNA为模板,通过克隆获得METTL3基因CDS区,并使用生物信息学软件进行相似性比对、系统进化树构建和生物信息学分析;利用RT-qPCR检测METTL3基因在湖羊9个不同组织中的表达水平。结果显示,获得的湖羊METTL3基因完整CDS区全长1749 bp,编码579个氨基酸。湖羊与山羊(Capra hircus)的亲缘关系最近。METTL3蛋白等电点为6.05,半衰期为30 h,结构不稳定,属于亲水性蛋白。METTL3具有一个MT-A70保守结构域,无信号肽和跨膜结构域。预测共有59个潜在磷酸化位点。METTL3蛋白高级结构由无规则卷曲(50.09%)、α-螺旋(33.85%)、延伸链(12.44%)和β-转角(3.62%)组成,且主要与METTL14、WTAP等参与m6A甲基化过程的相关蛋白紧密联系。RT-qPCR结果显示,METTL3 mRNA在湖羊9个组织中均有表达,与肌肉组织相比,肾、脾和皮下脂肪组织中的表达量更高(P<0.01)。本试验成功克隆获得METTL3基因CDS区全长序列,并初步研究了其在湖羊各个组织中的表达变化规律,为探索METTL3基因在哺乳动物生长发育过程中发挥的作用提供理论依据。

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