数字农科院2.0

棉花SRS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张雪;孙瑞斌;马聪聪;马丹;张晓睿;刘志红;刘传亮

作者机构：

关键词： 棉花;SRS;系统进化;表达模式;基因家族

期刊名称：棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2022 年 34 卷 2 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】短链相关序列(SHI-related sequence,SRS)家族是一类植物特有的转录因子,在调节植物生长发育和逆境胁迫反应中发挥重要作用。鉴定和分析棉花SRS基因家族成员。【方法】结合拟南芥相关信息,以陆地棉和海岛棉为主要研究对象,对棉花SRS基因进行全基因组鉴定和系统进化研究,并分析其在不同器官、不同发育时期的胚珠和纤维、以及在非生物胁迫下棉苗中的表达模式。【结果】在陆地棉和海岛棉中分别鉴定出27个和26个SRS基因,系统进化分析将棉花SRS基因家族成员划分为3个分支,不同分支都具有相似的保守基序。每个分支都存在多对同源基因。一些SRS基因在胚珠发育时期表达量较高,并响应多种非生物胁迫。【结论】分析预测了棉花SRS基因的家族成员进化关系与潜在功能,为棉花SRS基因的功能研究提供初步的理论基础。

分类号：

  • 相关文献

[1]陆地棉LTPG基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 吴翠翠,肖水平,夏芝,任文斌,任翔,张先亮. 2023

[2]普通烟草ERF转录因子亚家族成员鉴定及表达模式分析. 任昂彦,孔英珍. 2017

[3]大白菜GIF蛋白家族的生物信息学分析. 王凤德,李利斌,李化银,刘立峰,高建伟. 2012

[4]银杏C2H2型锌指蛋白家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 李建阳,熊思微,李贺勤,崔鹏,贺炳. 2025

[5]普通烟草KCS基因家族的鉴定及非生物胁迫表达模式分析. 郭存,刘晓姗,李志远,李浩昊,段柯帆,郑吉云,田华,王瑗申,商暾,叶柯妤,孙晋浩,李东徽,貊志杰,李尊强. 2023

[6]棉花中HD-Zip Ⅳ家族基因的全基因组鉴定及特征分析. 王瑞,鲁丽丽,刘拓,章志强,马宗斌,李伶俐,刘伟,杨作仁,朱伟. 2017

[7]陆地棉NAC转录因子基因GhNAC6的克隆、表达和耐盐性分析. 杨勇,田新权,刘会利,宋洁,张慧,龙璐,高巍. 2017

[8]棉花抗细胞凋亡基因GhDAD1的克隆、定位及表达分析. 龚文芳,喻树迅,宋美珍,范术丽,庞朝友,肖水平. 2010

[9]Genome-Wide Characterization of Shi-Related Sequence Gene Family and Its Roles in Response to Zn2+ Stress in Cucumber. Xinhui Zhang,Bilal Ahmad,Shuang Zeng,Yuhan Lan,Xin Hu,Lingling Fu,Tian Hu,Jinhua Li,Xingguo Zhang,Yu Pan,Dan Du. 2024

[10]兰花磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族生物信息学分析. 胡广隆,陈亚娟,魏建华,王宏芝,张杰伟. 2017

[11]毛果杨CBF/DREB1基因家族生物信息学分析. 丁咚,陈亚娟,崔进荣,魏建华,张玉红,张杰伟. 2018

[12]拟南芥和水稻CPP转录因子家族的生物信息学分析. 王凯. 2010

[13]桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析. 张杰伟,任飞,张中保,谢华,魏建华. 2017

[14]兰花eIF5A基因家族鉴定与生物信息学分析. 张杰伟,汤久杨,陈兰芬,王宁琳,王宏芝,魏建华. 2017

[15]猪带绦虫45W基因家族的克隆及A_3与B_2的表达和结构预测. 郑亚东,贾万忠,骆学农,景志忠,才学鹏. 2004

[16]硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发. 赵永涛,孔秀英,詹克慧. 2008

[17]猪带绦虫六钩蚴45W基因家族分子克隆. 才学鹏,郑亚东,贾万忠,骆学农,景志忠,陆承平. 2005

[18]花生白藜芦醇合成酶基因家族序列克隆及分析. 周元青,杨艳燕,黄家权,廖伯寿. 2008

[19]杨树磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析. 张杰伟,丁莉萍,陈亚娟,王宏芝,魏建华. 2016

[20]桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析. 张杰伟,吴婷,任飞,谢华,魏建华. 2017

作者其他论文 更多>>