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新疆新源县多房棘球蚴病病例特征及其病原基因多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 才仁;任远;米荣升;郭刚;齐文静;张壮志;郭宝平

作者机构：

关键词： 多房棘球蚴病;新源县;nad2基因;基因型

期刊名称：中国寄生虫学与寄生虫病杂志

ISSN： 1000-7423

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版）

摘要： 目的 了解新疆新源县人群多房棘球蚴病（alveolar echinococcoisis,AE）病例特征及其病原基因多态性情况,为制定AE预防控制策略提供参考。方法 收集2016—2020年新疆医科大学第一附属医院生物样品库中新源县AE患者的病例信息及其手术切除的肝脏病灶样品,提取肝脏病灶样品基因组DNA,PCR扩增线粒体NADH脱氢酶2基因（nad2）并测序,PCR产物经测序剪接后进行BLAST比对,用MEGA10.0软件采用邻接法构建系统进化树,DnaSPv5软件分析扩增序列的基因型,Network10.0软件制作nad2基因型网络图。结果 共收集AE病例28例,其中农区7例,巩乃斯河两岸流域21例;男性17例,女性11例,二者差异无统计学意义（χ2=0.704,P> 0.05）;民族分布中汉族12例、哈萨克族11例、维吾尔族3例、蒙古族1例、其他民族1例;职业分布中农牧民为主,占92.86%（26/28）,其他职业仅占7.14%（2/28）,不同职业间病例数差异有统计学意义（χ2=3.89,P<0.05）;年龄分布中以20～49岁年龄组为主,占78.57%（22/28）,其他年龄组占21.43%（6/28）,不同年龄组间病例数差异无统计学意义（χ2=0.418,P> 0.05）。25份多房棘球蚴肝组织病灶样品PCR扩增出大小约1031 bp的片段,与预期大小一致,另3份未扩增出条带。序列比对结果显示,25条序列分属H1、H2、H3和H4等4个基因型,其中H1为主要基因型（占72.0%,18/25）,与哈萨克斯坦（GenBank登录号AB461406）分离株序列一致性为100%。系统进化树结果显示,新源县病例分离株的4个基因型与波兰（GenBank登录号KY205700）和哈萨克斯坦（GenBank登录号AB461406）分离株在同一条分支上,但与法国（GenBank登录号AB461404）、奥地利（GenBank登录号AB461403）、加拿大（GenBank登录号JF751036）、美国阿拉斯加（GenBank登录号MT429275）、美国印第安纳（GenBank登录号AB461409）及中国内蒙古（GenBank登录号AB461411）分离株亲缘关系较远。基因型网络图结果显示,以H1为中心,H2、H3、H4、中国四川,波兰、加拿大及日本分离株呈散射状分布,表明这些分离株均与H1亲缘关系较近,但与法国、奥地利、加拿大,美国阿拉斯加等序列不在同一分支,亲缘关系较远。结论 本研究分析的28例AE患者主要为汉族和哈萨克族,农牧民占比较高,AE患者共有4个基因型,其中H1属新源县主要基因型。

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