数字农科院2.0

桃的花型性状相关SNP位点挖掘与候选基因分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孟歌;朱更瑞;方伟超;陈昌文;王新卫;王力荣;曹珂

作者机构：

关键词： 观赏桃育种;重测序;单核苷酸多态性;候选基因

期刊名称：植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2022 年 2 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 桃的花型分为铃型和蔷薇型,铃型花朵小且边缘卷曲,蔷薇型花朵大且完全展开,蔷薇型重瓣花是观赏桃育种者追求的主要目标性状之一.目前,与桃铃型/蔷薇型花型性状连锁的分子标记研究较少,限制了桃的花型性状分子标记辅助育种进程.为了鉴定与桃花型关联的单核苷酸多态性(SNP,single-nucleotide polymorphisms)位点并挖掘候选基因,本研究通过对199份桃品种进行重测序,获得了 1042687个SNP.采用一般线性模型对桃花型性状进行全基因组关联分析(GWAS,genome wide association study),获得7个与 目标性状显著关联的位点,其中2个位于2号染色体,5个位于8号染色体.进而对8号染色体的3个SNP进行竞争性等位基因特异性PCR(KASP,kompetitive allele-specific PCR)分型,在5个F1群体中进行进一步验证.x2验证结果表明:Chr.8:14484624 bp与桃花型性状显著关联.5个F1群体基因型和表型的对应关系表明,Chr.8:14484624 bp准确率最高,为93.46％.组织特异表达结果显示,在上述定位区间内的6个注释基因中,Prupe.8G118100在花中特异表达,将其视为桃花型性状的候选基因.本研究鉴定了桃铃型/蔷薇型花型性状关联位点,并对候选基因进行了筛选,以上结果可进一步转化为分子标记,用于观赏桃分子标记辅助选择育种.

分类号：

  • 相关文献

[1]烤烟烟碱含量的全基因组关联分析. 孙鑫,文柳璎,尹鹏嘉,罗成刚,樊文强,任民. 2017

[2]基于RAD重测序技术开发烟草品种SNP位点. 任民,程立锐,刘旦,蒋彩虹,杨爱国. 2018

[3]烤烟品种中川208特异性指纹图谱的构建及分析. 贾振国,王亚男,罗成刚,张玉,耿锐梅,陈志强,杨爱国,刘国祥,任民. 2023

[4]中畜草原白羽肉鸭与樱桃谷鸭的遗传差异分析. 于思梦,郭占宝,胡健,周正奎,侯水生. 2022

[5]棉籽大小数量性状核苷酸定位及候选基因初步筛选. 乔丹,白冰楠,葛群,刘小芳,栾玉娟,牛皓,龚举武,巩万奎,闫浩亮,李俊文,刘爱英,石玉真,Elsamman Elameer,陈全家,袁有禄. 2024

[6]长三角地区兼用型鸭全基因组遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫,刘怡. 2017

[7]大白菜InDels标记开发及其在剩余杂合体鉴定中的应用. 张志刚,赵智中,李巧云,王晓,刘栓桃,王淑芬,徐文玲,刘贤娴,刘辰. 2016

[8]动物基因组学重测序的应用研究进展. 汪文强,赵生国,马利青,郭继军,马月辉,赵倩君. 2016

[9]动物基因组学重测序的应用研究进展简. 汪文强,赵生国,马利青,郭继军,马月辉,赵倩君. 2016

[10]基于重测序的染色体片段代换系定位水稻抽穗期QTL. 王军,朱金燕,陶亚军,周勇,范方军,李文奇,王芳权,仲维功,杨杰,梁国华. 2017

[11]玉米DCL1基因鉴定及其自然等位变异分析. 徐东东,赵永平,王建海,周强,谢传晓. 2015

[12]基于黄瓜基因组重测序的InDel标记开发及其应用. 李斯更,沈镝,刘博,邱杨,张晓辉,张忠华,王海平,李锡香. 2013

[13]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[14]基于测序技术的畜禽基因组学研究进展. 梁素芸,周正奎,侯水生. 2017

[15]桑叶葡萄叶绿体基因组及其特征分析. 杨亚蒙,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,李民,刘崇怀. 2019

[16]山东省主要栽培苹果基因组重测序及SNP芯片位点挖掘. 段乃彬,马玉敏,王昆,王效睦,谢坤,白静,杨永义,蒲艳艳,宫永超. 2021

[17]黄瓜嫩果皮色基因QTL定位分析. 窦文文,沈镝,麦尔旦·努尔阿伍提,董洪霞,邱杨,李锡香. 2018

[18]西瓜基因组框架图谱绘制与20份代表性资源重测序研究. 郭绍贵,许勇,张建国,孙宏贺,Jerome Salse,William JLucas,张海英,Yi Zheng,毛林勇,任毅,王志文,闵久梦,郭晓森,Florent Murat,Byung-Kook Ham,张召亮,高山,黄明云,徐益民,钟思林,Aureliano Bombarely,Lukas AMueller,赵泓,何洪巨,张岩,张忠华,黄三文,谭涛,庞尔丽,林魁,胡群,匡汉辉,倪培相,王博,刘景安,孔秋生,侯文菊,邹小花,江姣,宫国义,Kathrin Klee,Heiko Schoof,黄莹,胡雪松,董珊珊,梁德全,王娟,吴奎,夏阳,赵翔,郑泽群,邢淼,梁新明,黄邦清,吕添,王军一,尹烨,伊鸿平,李瑞强,吴明珠,Amnon Levil,张兴平,James JGiovannoni,王俊,李云伏,费章君. 2019

[19]烟草航天诱变突变体变异检测及分析. 周世奇,刘东阳,潘旭浩,屈建康,程立锐,任民,晁江涛,张玉,罗成刚. 2019

[20]大豆百粒重相关基因的全基因组发掘分析. 宿洋,杨静,郭勇,杜维俊,邱丽娟. 2021

作者其他论文 更多>>