文献类型： 中文期刊
作者： 王元清;王泽昭;朱波;陈燕;徐凌洋;张路培;高会江;李超;李俊雅;高雪
作者机构：
关键词： 华西牛;基因组选择;标记密度;育种芯片;中国肉牛基因组选择指数
期刊名称：畜牧兽医学报
ISSN： 0366-6964
年卷期： 2024 年
页码：
收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）
摘要： 旨在基于Illumina BovineHD 770K与Cattle 110K芯片在华西牛中的实际应用情况，系统比较在不同标记密度下基因组选择预测准确性的差异，探索两款芯片在华西牛遗传评估中结合使用方法。本研究以课题组前期构建的华西牛基因组选择参考群体为研究对象，利用重测序数据将3 948头华西牛770K芯片填充至790K后，分别取90K（两款芯片交集）、110K、770K、790K（两款芯片并集）四种标记密度，对华西牛遗传评估所涉及的五个性状（断奶重、平均日增重、产犊难易度、胴体重、屠宰率）进行遗传力估计，并通过GBLUP模型利用五折交叉验证对基因组评估准确性进行了比较，筛选并确定华西牛遗传评估中最适标记密度。结果显示：1）4种标记密度下，估计的华西牛5个性状遗传力差异不显著，断奶重和平均日增重的遗传力为0.47～0.50，属于高遗传力；胴体重为0.37～0.39，属于中等遗传力；产犊难易度和屠宰率性状为0.14～0.21，属于中低遗传力。2）在GBLUP评估模型中，Cattle 110K在各个性状上的预测准确性均表现良好，并较Illumina BovineHD 770K芯片有显著提升（P < 0.05），其中胴体重、产犊难易度和屠宰率3个性状提升较为明显，分别提升了14.9%、13.8%和8.4%；断奶重和育肥期平均日增重分别提升 2.8%和4.5%。3）各性状预测准确性随着遗传力的升高而增加，不同标记密度的回归系数分别为0.439 2（90K）、0.374 1（110K）、0.413 6（770K）、0.459 3（790K）。因此，在华西牛实际遗传评估中，可直接使用Cattle 110K芯片进行评估，在获得较好评估准确性的同时降低成本。
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