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烟草NtJAR1家族基因的鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 章照停;杨梦璇;徐方正;毛东平;李世金;王倩;徐刚;宁扬

作者机构：

关键词： JAR1基因;烟草;冷胁迫;生物信息学分析;表达模式

期刊名称：湖南农业科学

ISSN： 1006-060X

年卷期： 2025 年 6 期

页码：

收录情况： 农林核心（2024版）

摘要： 为了研究烤烟激素代谢和逆境胁迫响应机制,基于烟草(Nicotiana tabacum L.)全基因组数据,利用生物信息学方法鉴定了烟草中茉莉酸-异亮氨酸合成酶基因(Jasmonoyl-isoleucine synthetase,JAR1)家族,并分析该家族的蛋白质理化性质、进化关系以及基因结构、保守结构域、启动子核心顺式作用元件以及转录模式。结果表明:烟草中共鉴定到12个NtJAR1基因,在系统发育上将其分为2个亚族(Ⅰ类和Ⅱ类),包含360~630个氨基酸,等电点为5.56~6.93,分子量为40.22~68.94 KDa,均为两性蛋白且热稳定性一致,除NtJAR1-3、NtJAR1-6、NtJAR1-9和NtJAR1-12位于细胞核中之外,剩余蛋白均定位在细胞质中；所有NtJAR1基因均具有GH3保守结构域,含有3~5个外显子,2~5个内含子；烟草NtJAR1基因家族的表达模式具有组织特异性,NtJAR1-5、NtJAR1-6、NtJAR1-8、NtJAR1-10、NtJAR1-7、NtJAR1-4在根中高度表达,NtJAR1-3、NtJAR1-12则在叶中高度表达；NtJAR1基因响应烟草冷胁迫,其中NtJAR1-7、NtJAR1-8、NtJAR1-10、NtJAR1-12基因在冷胁迫条件下表达上调。

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