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辣椒C2H2型锌指蛋白家族基因鉴定及其在涝胁迫下的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王楠艺;范高领;付文婷;吴迪;杨娅;黄冬福;王立浩;吴康云;何建文

作者机构:

关键词: 辣椒;C2H2型锌指蛋白;涝胁迫;生物信息学

期刊名称:江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2025 年 41 卷 01 期

页码:

收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)

摘要: 为了探究辣椒C2H2型锌指蛋白家族在响应涝胁迫中的作用,本研究通过生物信息学方法对辣椒C2H2型锌指蛋白家族蛋白理化性质、基因结构、染色体定位、顺式作用元件进行了全面分析。结果表明,辣椒C2H2型锌指蛋白家族包含91个成员,多数成员定位于细胞核。91个成员可被分为6个亚族,不同亚族的成员基因结构存在差异。C2H2型锌指蛋白家族基因启动子区域主要包含植物生长发育元件、植物激素响应元件及逆境胁迫响应元件。对耐涝辣椒资源GC41和涝胁迫敏感型辣椒资源GC39在涝胁迫下的转录组数据进行分析,结果表明,在GC41中,CaC2H2-17、CaC2H2-87在涝胁迫处理3 d时相对表达量高,CaC2H2-17、CaC2H2-87在GC39中未表达。筛选出...

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