茶树CsCDF1基因克隆及表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 胡娟;王丽鸳;韦康;成浩;张成才;张芬;吴立赟
作者机构:
关键词: 茶树;Dof基因;CsCDF1基因;光调控;氮素;表达分析
期刊名称:茶叶科学
ISSN: 1000-369X
年卷期: 2015 年 05 期
页码: 501-511
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用SMART-RACE技术克隆了茶树Dof(DNA binding with one finger)基因CsCDF1的全长c DNA序列,并利用在线生物信息学软件对其进行了分析。采用实时荧光定量PCR分析该Dof基因在茶树不同组织间的表达差异和昼夜表达规律,及其在氮饥饿处理2周后对不同浓度氮素诱导的响应。该c DNA序列全长1 606 bp,包含1个编码464个氨基酸的完整开放阅读框,含有高度保守的DOF结构域,推导的蛋白分子量为50.8 k Da,理论等电点(PI)为5.52;其编码的蛋白序列与茸毛烟草、马铃薯和美花烟草的CDF蛋白(Cycling dof factor)相似性分别为69%、67%、68%。系统发育分析结果表明,该基因编码的氨基酸序列与拟南芥CDF蛋白聚为一类,因此将其命名为CsCDF1;CsCDF1在3个不同茶树品种根系中的表达量均高于一芽二叶和成熟叶;在一天中,该基因的表达呈现出昼夜节律变化;在氮饥饿后重新供氮,不同组织中该基因对不同浓度氮素的响应均为上调。
分类号: S571.1
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