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北京黑猪NR6A1、VSX2、VRTN、LTBP2基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 牛乃琪;刘倩;侯欣华;刘欣;王立刚;赵福平;高红梅;石丽君;王立贤;张龙超

作者机构：

关键词： 北京黑猪;基因;脊椎数;胴体性状;关联

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 旨在研究NR6A1、VSX2、VRTN、LTBP2基因在北京黑猪群体中基因的多态性与脊椎数和胴体性状（胴体长、胴体直长、胴体斜长及胴体重）的关联。本研究提取410头（210±7）日龄健康北京黑猪耳组织DNA，通过PCR技术和Sanger测序技术对4个基因外显子区进行基因分型，计算变异位点基因型频率以及等位基因频率的分布，并与脊椎数和胴体性状进行关联分析。结果表明，在VSX2、VRTN、LTBP2三个基因中共筛选到15个SNPs，其中包含1个CDS区的同义突变和14个3′UTR突变。使用Duncan′s多重检验统计分析发现，VSX2基因中CDS区的1个突变c.536 G>A 与脊椎数关联显著（P<0.05）。VRTN 中3′UTR区共4个突变与性状关联显著（P<0.05），其中c.2598 A>G和c.2607 G>T与脊椎数、胴体长、胴体直长及胴体斜长关联显著，c.3087 G>C只与胴体斜长关联显著，c.3094 A>G与脊椎数及胴体斜长关联显著（P<0.05）。LTBP2上6个3′UTR突变位点（c.7158 A>G、c.6869 C>T、c.6319 G>C、c.6246 G>T、c.6170 A>G、c.6079 G>T）与脊椎数关联显著（P<0.05），但与胴体性状关联不显著。综上所述，VSX2、VRTN、LTBP2基因中共有10个SNPs与脊椎数性状关联显著（P<0.05），仅VRTN基因中4个SNPs与胴体性状关联显著（P<0.05）。这些关联显著的SNPs可以作为北京黑猪脊椎数及胴体性状变异的候选基因功能位点。

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