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基于简化基因组测序的四种乌头的遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李政;李红钰;张志东;邵财;逄世峰;许世泉;张浩

作者机构：

关键词： 乌头属;SLAF-seq;遗传结构;遗传多样性

期刊名称：分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 为探明乌头种群的遗传结构和遗传多样性，估算遗传潜力，助力乌头属植物遗传资源保护和遗传改良育种。本研究利用简化基因组技术（SLAF-seq）分析了四个乌头群体：黄花乌头（A. coreanum）、北乌头（A. kusnezoffii）、圆锥乌头（A. paniculigerum）和敦化乌头（A. dunhuaense）)的遗传结构。共发掘402 624个高一致性单核苷酸多态性位点（SNPs），基于这些SNPs的多种分析表明，乌头群体划分为6个遗传谱系，黄花乌头与北乌头、敦化乌头和圆锥乌头明显区分开来，北乌头的进化时间最长。观测杂合度（Ho）为0.401 82～0.547 56，期望杂合度（He）为0.403 13～0.435 05，多态性信息含量（PIC）为0.31822～0.33725，Nei’s遗传多样性指数（H）为0.495 44～0.542 44，Shannon’s遗传多样性指数（I）为0.58957～0.62396，遗传分化系数（Fst）为0.338 52～0.519 34。乌头群体之间存在较高遗传分化水平的同时群体内部也存在较高的遗传多样性水平。我们认为乌头属植物复杂的染色体组成、种群之间频繁的基因交流促成了乌头属植物种群较高的遗传多样性水平。本研究为研究不同乌头品种亲缘关系、开发其特异性SNPs标记、指导乌头属植物种质资源保护和利用提供理论支撑。

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