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2种核酸快提取法对羊口疮病毒和羊痘病毒DNA提取效能的比对研究

文献类型： 中文期刊

作者： 谭小雨;杨洋;郭紫晶;李彦敏;张志东

作者机构：

关键词： 快速核酸提取试剂;羊口疮;羊痘;qPCR;RPA-LFD

期刊名称：畜禽业

ISSN： 1008-0414

年卷期： 2023 年 34 卷 5 期

页码：

收录情况： 不在遴选数据库范围（2023版）

摘要： 目的合理选择病毒快速核酸提取方法。方法分别采用2种商品化核酸快提取法——Cell-to-cDNA裂解液(A法)和基于磁珠核酸提取方法(InnuPREP MP Basic Kit A,B法),提取羊临床样品中的羊口疮病毒(ORFV)和羊痘病毒(CaPV)核酸,使用实时荧光定量核酸扩增检测系统(qPCR)和重组酶聚合酶扩增结合侧流层析技术(RPA-LFD)方法进行平行检测,并与常规核酸提取方法(宝生物病毒DNA/RNA提取试剂盒,C法)比较。结果与C法相比,在A法和B法提取的46份疑似orf拭子中,qPCR的ORFV核酸检出率分别为70.8%和87.5%,RPA-LFD的检出率分别为69.5%和82.6%;在A法和B法提取的52份疑似CaP的拭子样品中,qPCR的CaPV核酸检出率分别为77%和90%,RPA-LFD的检出率分别为65.5%和89.7%。对组织样品分析发现:A法不能用于组织样品的核酸提取;在B法提取的52份疑似orf组织样品核酸中,与C法相比,qPCR的ORFV核酸检出率为93.7%,RPA-LFD的检出率93.3%;对B法提取的61份疑似CaP组织样品核酸中,qPCR的CaPV核酸检出率为94.5%,RPA-LFD的检出率为88.7%。结论磁珠核酸提取方法(B法)可适用于不同样品中的ORFV和CaPV核酸的快速提取。

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