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一株H1N1亚型猪流感病毒全基因组特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张傲;谭斌;刘可欣;刘佳利;张淑琴

作者机构：

关键词： 猪流感病毒;H1N1亚型;分离鉴定;遗传进化分析;选择压力分析

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为了解吉林地区猪流感病毒（swine influenza virus，SIV）的流行情况并探究其分子生物学特征，本研究采集吉林某猪场疑似SIV感染猪的鼻拭子样品接种鸡胚分离病毒并对该分离株进行全基因组扩增、遗传进化分析、功能性氨基酸位点分析及选择压力分析。结果显示：病毒分离鉴定表明分离株为H1N1亚型SIV，遗传进化分析显示分离株全基因组的8个基因节段均属于经典猪流感病毒谱系，未出现流感病毒不同基因型之间的基因重排。功能性氨基酸位点分析显示毒株出现SIV致病性、毒力及复制能力增强的相关位点突变，NA基因具有神经氨酸酶抑制剂耐药性相关位点突变。选择压力分析显示SIV HA和NA基因在吉林省的自主变异进化明显，NA的突变率高于HA。本研究获得的H1N1亚型SIV分离株全基因组序列分析结果对SIV流行病学调查及后续疫苗研发具有一定意义。

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