通过普通转录组测序挖掘调控松辽黑猪脂肪沉积的关键lncRNA及其靶基因
文献类型: 中文期刊
作者: 刘怡冰;邢凯;敖红;翟丽维;张丰霞;余健;刘华涛;石咏;马骏;王楚端
作者机构:
关键词: 猪 ; 转录组 ; lncRNA ; 脂肪沉积
期刊名称:中国畜牧杂志
ISSN: 0258-7033
年卷期: 2021 年 57.0 卷 z1 期
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)
摘要: 脂肪沉积性状是养猪生产中重要的经济性状,本研究通过对3对具有极端背膘厚度的松辽黑猪全同胞(半同胞)个体的背部皮下脂肪组织进行普通转录组测序,鉴定得到1029个lncRNA,其中已知lncRNA 343个,新预测的lncRNA 686个.进行差异表达分析后,筛选到37个lncRNA和435个基因在高、低背膘组间差异表达.进一步对差异表达lncRNA进行靶基因预测,共得到54个顺式靶基因,245个反式靶基因,这些靶基因显著富集到多条脂肪合成及代谢相关的通路,包括脂肪酸代谢、不饱和脂肪酸的生物合成等.
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