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小反刍兽疫病毒P基因的克隆及其结构与功能分析

文献类型： 中文期刊

作者： 翟军军;窦永喜;张海瑞;毛立;蒙学莲;骆学农;才学鹏

作者机构：

关键词： 小反刍兽疫病毒;P蛋白;克隆;结构与功能;分析

期刊名称：中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2010 年 43 卷 11 期

页码： 2355-2362

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】对小反刍兽疫病毒P基因进行克隆,并对其结构和功能的关系进行分析,为研究小反刍兽疫病毒P蛋白的功能及其在病毒增殖过程中的作用奠定基础。【方法】利用RT-PCR的方法对小反刍兽疫P基因全长进行克隆,通过生物学软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对,利用I-TASSER进行三级结构预测,然后分析其结构和功能之间的关系。【结果】P基因和MV、CDV、RPV、DMV和PDV的P基因的相似性分别为62.9%、63.3%、64.4%、65.1%和60.4%,氨基酸的相似性分别为45.9%、46.2%、50.6%、50.3%和47.0%。三级结构表明该蛋白由3个结构域构成,中间是由多个α-螺旋构成的结构域,主要行使与L大蛋白和RNA结合的功能,两边分别是N-端和C-端结构域,C-端结构域含有3个α-螺旋,分别位于458—468aa、492—499aa和503—505aa位,主要作为N蛋白α-螺旋的结合位点。【结论】本研究成功地克隆小反刍兽疫病毒P基因,分析和预测了p蛋白的结构和功能的关系,为其进一步的生物学功能研究及其应用奠定了基础。

分类号： S852.65

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