数字农科院2.0

西双版纳黄瓜Cs-Psy1基因的序列特征与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 卢萍;王柬人;李锡香;宋江萍;邱杨;王海平;张晓辉;沈镝

作者机构:

关键词: 西双版纳黄瓜;八氢番茄红素合成酶;克隆;实时荧光定量PCR;表达

期刊名称:植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2016 年 17 卷 06 期

页码: 1050-1057

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 西双版纳黄瓜是我国特有的果肉橙黄色的黄瓜变种资源,不同种质间的β-胡萝卜素含量差异明显。PSY是胡萝卜素生物合成途径中的第1个限速酶。本文以西双版纳黄瓜为试材,分别克隆西双版纳黄瓜八氢番茄红素合成酶(Cs-PSY1)的DNA和c DNA序列,结果显示,DNA长2797 bp,包含5个内含子和6个外显子,c DNA序列长1385 bp,编码421个氨基酸。Psy1推测的氨基酸序列包含该家族的2个特征序列,保守性很高。该蛋白为不稳定蛋白,无明显疏水区,未预测到跨膜结构;系统进化分析结果显示,西双版纳黄瓜的Cs-PSY1蛋白与甜瓜的同源性较高;与栽培黄瓜深度测序材料"9930"和"GY14"的序列进行比较分析,结合115份黄瓜重测序结果,共发现5个SNP,其中2个位于起始密码子上游27 bp处和971 bp处,3个位于内含子区域。其中SNP4在重测序的19份西双版纳黄瓜中的突变率为100%,在96份栽培黄瓜中的特异性为5.3%。转录因子结合位点预测结果显示,在普通栽培黄瓜该位点处存在一个CTAG motif,在西双版纳黄瓜中该位点突变后则不存在该motif。利用实时荧光定量PCR技术分析Cs-Psy1的表达量变化趋势,结果表明,在黄瓜不同果实发育时期,该基因的表达量均呈现先上升后下降的趋势,在西双版纳黄瓜中表达量变化的差异明显,在授粉后50 d达到最大值,是果实发育初期表达量的8倍多,是同时期普通黄瓜的4倍多,而普通黄瓜表达量的总体变化相对平缓。西双版纳黄瓜果实内果皮的表达水平明显高于中果皮,最高相差约5倍,普通黄瓜差异不明显。从上述研究结果推测Psy1基因可能影响西双版纳黄瓜的β-胡萝卜素积累。

分类号: S642.2

  • 相关文献

[1]黄瓜ζ-胡萝卜素脱氢酶基因克隆及表达分析. 王柬人,李锡香,王海平,邱杨,宋江萍,张晓辉,沈镝. 2012

[2]THBS3基因在长白猪和通城猪不同组织和不同时期骨骼肌中的表达分析. 马喜山,唐中林,肖冲,杨博超,秦川. 2016

[3]大豆中GmKAB1基因的克隆和信息学分析. 朱晓玲,郝青南,陈海峰,王程,陈李淼,沙爱华,陈水莲,周蓉,周新安. 2014

[4]家蚕DnaJ5基因的克隆与表达谱分析. 步翠玉,宗志鹏,李轶女,张志芳,张耀洲. 2009

[5]美仁牦牛PDK4基因克隆及组织表达. 马小勇,戴荣凤,李歆怡,杨国武,扎老,路建卫,赵雪,梁春年. 2023

[6]西瓜八氢番茄红素合成酶基因片段的克隆和序列分析. 康保珊,赵文恩. 2007

[7]西瓜八氢番茄红素合成酶基因全长的克隆与表达分析. 吕品,李娜,刘慧,赵文恩. 2014

[8]柔嫩艾美耳球虫子孢子高表达新基因的克隆、表达及分析. 李洋,韩红玉,董辉,赵其平,姜连连,朱顺海,郭涛,平宪卿,马卫娇,曾艳波,程军,黄兵. 2010

[9]马鹿布氏杆菌25kDa外膜蛋白基因的克隆、序列分析及其表达研究. 乔军,才学鹏,孟庆玲,景志忠,张艳,贾桂珍. 2007

[10]两种入侵粉虱热激基因Hsp70的克隆及温度胁迫下的种间差异表达. 雷仲仁. 2010

[11]苏云金芽孢杆菌cry1Aa14基因的分离、克隆及其表达. 宋福平,陈中义,李国勋,王勤英,黄大昉,张杰. 2004

[12]天祝白牦牛Y染色体性别决定基因(SRY)编码区的克隆和原核表达. 裴杰,阎萍,厍睿,程胜利,冯瑞林,梁春年,郭宪,曾玉峰,包鹏甲,朱新书. 2009

[13]乙型脑炎病毒E蛋白基因的原核表达及ELISA抗体检测方法的建立. 刘昊,尹革芬,鲁会军,张丹,谭磊. 2010

[14]猪囊尾蚴磷蛋白基因P2的克隆及在大肠杆菌中的表达. 骆学农,才学鹏,陈怀涛,刘湘涛. 2003

[15]甘蔗脱落酸胁迫成熟诱导蛋白基因(SoASR)的克隆和表达分析. 杨丽涛,张保青,宋修鹏,李杨瑞. 2013

[16]家蚕浓核病毒(镇江)株主要结构蛋白基因的克隆及表达. 许光治,张志芳,覃光星,黄可威,郭锡杰. 2004

[17]猪瘟病毒p80基因NTPase/RNA解旋酶功能区在E.coli中的表达. 庄淑珍,刘湘涛,韩雪清,张彦明,张永国,薛青红,冯卫权,谢庆阁. 2003

[18]日本血吸虫基因重组抗原rSj06868对小鼠的免疫保护效果. 王素娟,刘金明,邢荣鹤,石耀军,金亚美,李浩,林矫矫. 2011

[19]牛趋化因子受体4基因的克隆表达及序列分析. 李小庆,何延华,陈国华,房永祥,冯海燕,赵娜,景志忠. 2009

[20]H3N2亚型猪流感病毒NS2基因表达产物特性分析. 郭林,王晓杜,刘庆伟,沈阳,邱亚峰,李向东,罗满林,马志永. 2014

作者其他论文 更多>>