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几个地方鸡种MHCB-G座位克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 屠云洁;苏一军;张学余;李国辉

作者机构：

关键词： MHC;克隆;生物信息学;鸡

期刊名称：中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2012 年 48 卷 15 期

页码： 8-11

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究利用PCR和克隆测序方法,克隆新狼山鸡和仙居鸡MHC B-G基因全序列,分析序列的多态性并预测其蛋白质的结构与功能,为更好地保护地方鸡种提供基础资料。结果表明:分别获得新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G基因6 183 bp和6 415 bp全序列,与红色原鸡同源性达98%,3鸡种存在148个变异位点,为3个单倍型,单倍型多样度为0.07407,仙居鸡在4413-4661位置缺失249 bp;利用生物信息学预测新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G蛋白,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点;新狼山鸡和仙居鸡有明显的跨膜螺旋结构,分别含有138个和98个磷酸化位点;MHC B-G基因具有丰富的遗传多样性,该MHC B-G蛋白可能是抗原位点的富集区,对其进化、抗原递呈作用以及疾病和生产性能的相关性发生重要影响。

分类号： S831.2

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