文献类型： 中文期刊
作者： 尹彦文;熊陈勇;韦伟;施开创;郑敏;崔鹏飞;韦显凯;李致远;刘惠心;冯淑萍;卢春花;屈素洁;陆文俊;李雪珍;王睿敏;邓国华;欧长波
作者机构：
关键词： 禽流感病毒;H3N2亚型;遗传进化;相似性
期刊名称：中国畜牧兽医
ISSN： 1671-7236
年卷期： 2025 年 09 期
页码：
收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）
摘要： 【目的】探究H3N2亚型禽流感病毒（AIV）广西毒株分子遗传进化特征。【方法】采集2020—2024年广西各地的家禽咽拭子和肛拭子病料,采用实时荧光定量RT-PCR方法鉴别检测H3N2亚型AIV,选取部分阳性样本经尿囊腔接种SPF鸡胚,收集鸡胚尿囊液,提取核酸后通过PCR扩增血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）基因并测序,进行序列相似性、系统发育、氨基酸变异位点及遗传进化速率分析。【结果】共获得43株HA和NA基因序列,编码区大小为1 701和1 410 bp。相似性比对分析显示,本研究获得的HA和NA基因之间核苷酸序列相似性分别为86.0%～99.9%和89.7%～99.9%,与GenBank中禽源、人源、猪源和犬源核苷酸序列相似性分别为78.4%～99.7%和78.1%～99.1%。广西H3N2亚型AIV毒株HA和NA基因属于欧亚谱系,与禽源亲缘关系最近,与人源/猪源最远。HA蛋白在第18—20、22—24、38—40、54—56、61—63、181—183、301—303和499—501位氨基酸处出现糖基化,NA蛋白在第61—63、69—71、86—88、143—145、146—148、200—202、234—236、313—315和402—404位氨基酸处出现糖基化,部分氨基酸位点发生变异;HA蛋白裂解位点为340PEKQTR↓GLF348和340PERQTR↓GLF348。遗传进化速率估算结果显示,HA和NA基因遗传进化速率分别为3.26×10-3和3.67×10-3替换/（位点·年）,HA基因种群规模在不同时间段表现出不同的动态进化特征。【结论】H3N2亚型AIV广西流行毒株与同种流行毒株亲缘性较近,部分HA和NA蛋白发生特有氨基酸突变,不同种属毒株进化趋势不一致,具有遗传多样性特征。试验结果为防控H3N2亚型AIV提供基础数据。
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