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5株H6N3亚型禽流感病毒的分子特征及遗传演化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈源;崔鹏飞;施建忠;邓国华;陈化兰

作者机构：

关键词： H6N3;禽流感病毒;活禽交易市场;分子特征;基因重配

期刊名称：中国家禽

ISSN： 1004-6364

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为了解H6N3亚型禽流感病毒（AIV）的遗传演化特点，试验对2023年采集自广东、湖北两地的活禽交易市场禽类咽喉拭子及泄殖腔拭子进行病原分离鉴定，并对分离的H6N3亚型AIV进行全基因组序列测定，进一步分析其遗传演化情况和特殊分子标记。结果显示：共分离到5株H6N3亚型AIV，且均为新型重配病毒，可分为2种基因型，其中4株湖北分离株属于基因1型，NA基因进化支相对独立，其余基因片段与分离于我国家禽的H3N2、H3N3、H3N8、H6N6亚型AIV有着较近的亲缘关系；1株广东分离株属于基因2型，与多种不同亚型野鸟源病毒高度同源；5株分离株HA蛋白的裂解位点序列仅有一个碱性氨基酸，符合低致病性禽流感病毒（LPAIV）的特征；4株湖北分离株的NA基因全长仅有1 365 bp，其编码的NA蛋白出现茎部缺失；部分分离株HA蛋白获得A138S突变，一株病毒的PB2蛋白获得I292V突变。综上所述，分离的5株H6N3亚型AIV为新型重配病毒，部分分离株获得哺乳动物适应性突变，应加强对H6亚型AIV的流行病学监测。

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