基于全基因组SNP位点和性状特征解析我国野生肺形侧耳的遗传多样性
文献类型: 中文期刊
作者: 岳园园;胡哲源;何琪;黄晨阳;郑素月;赵梦然
作者机构:
关键词: 秀珍菇;遗传变异;单核苷酸多态性;表型特征
期刊名称:生物技术通报
ISSN: 1002-5464
年卷期: 2025 年
页码:
收录情况: EI(2025版) ; ; 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: 【目的】探究我国野生肺形侧耳(Pleurotus pulmonarius)的遗传变异水平,以期为新品种选育提供优异亲本材料和数据支撑。【方法】利用全基因组重测序技术获得的SNP标记对37个野生肺形侧耳菌株进行遗传多样性分析,同时观测其菌丝培养特征和结实性等表型性状。【结果】在供试野生菌株中检测到的SNP数量范围在71 521-114 390个之间,菌株间遗传距离的平均值为0.180;聚类分析发现,大部分来自同一采集地点的菌株亲缘关系更为接近,与云南相比,采自陕西、四川、新疆地区的菌株亲缘关系较为接近。野生菌株在菌丝生长适宜温度、菌丝温度敏感性、菌丝恢复生长等培养特征上以及原基形成和分化、子实体成熟、菌盖颜色等结实特性方面呈现出丰富的表型多样性,基于表型特征的聚类分析结果表明,所有菌株在SM相似系数为0.52水平上能够按照原基能否正常分化分成两大组,这与主成分分析的类群划分结果高度一致。【结论】我国肺形侧耳野生种质资源遗传多样性丰富,具有良好的驯化利用潜力,野生菌株基因组水平上的遗传分化程度可能与其地理分布有关,与表型特征无明显相关性。
分类号:
- 相关文献
[1]棉杆替代棉籽壳栽培柱状田头菇、秀珍菇. 张瑞颖,郭德章,林原,陈剑,杨昕,胡清秀. 2012
[2]不同温度和培养基对秀珍菇木霉共培养的影响. 兰清秀,柯斌榕,卢政辉,马璐,黄晨阳,廖剑华. 2022
[3]半合成和天然培养基对秀珍菇菌种保藏效果的影响. 兰清秀,柯斌榕,卢政辉,马璐,黄晨阳,廖剑华. 2022
[4]秀珍菇全基因组SSR位点分析及其在遗传多样性评估中的应用. 周思琦,龚文兵,夏志兰,吴秋云,王亚东. 2023
[5]硅酸盐细菌PCR鉴定方法的建立和应用. 曹凤明,关大伟,葛一凡,姜昕,沈德龙,李俊. 2010
[6]关于硅酸盐细菌分类研究的历史及现状. 徐玲玫. 2001
[7]玉米果穗养分运输组织的表型研究进展. 邵萌,张颖,郭新宇. 2016
[8]放牧对三江源区高寒草甸主要植物表型特征的影响. 石红霄,侯向阳,师尚礼,贺晶,胡宁宁. 2015
[9]鹅观草属8种植物形态学特征的比较研究. 肖海峻,徐柱,李临杭,马玉宝. 2006
[10]混种非洲狗尾草对紫茎泽兰表型特征的影响. 曹志勇,桂富荣,李正跃,万方浩. 2010
[11]无角牦牛Hesx1基因多态性及其与生长性状的关联分析. 张浩,王宏博,马武,贾聪俊,马晓明,吴晓云,褚敏,阎萍,成述儒,梁春年. 2019
[12]采用基于高分辨率熔解曲线技术的SNP标记定位徐州142无絮的短绒控制基因. 吴春珲,马启峰,李海晶,王文魁,裴文锋,李兴丽,吴嫚,张金发,于霁雯,喻树迅. 2017
[13]柑橘溃疡病抗性SNP验证及其相关钙依赖性蛋白激酶基因诱导表达. 彭蕴,雷天刚,邹修平,张靖芸,张庆雯,姚家欢,何永睿,李强,陈善春. 2020
[14]鹅CYP2C45基因核心启动子的鉴定及其多态性与产肝性能的关系. 王倩,张蕊,赵星,张宜辉,龚道清. 2017
[15]绵羊KITLG基因的表达及其多态性与产羔性状关联分析. 张军霞,乐祥鹏,王维民,谢云龙,王志兰,张娜娜,胡瑞雪,孙武,邓颖,李发弟,喇永富. 2017
[16]稻瘟病抗性基因Pi25特异性CAPS标记的开发与验证(英文). 王惠梅,陈洁,施勇烽,潘刚,沈海超,吴建利. 2012
[17]基于EST序列的烟草cSNP发掘. 龚达平,王鲁,李凤霞,王卫锋,刘贯山,孙玉合. 2012
[18]绵羊H-FABP基因单核苷酸多态性的研究. 乔海云,赵倩君,姚娜,卢亚洲,孟详人,韩健林,关伟军,马月辉. 2009
[19]单核苷酸多态性在多倍体作物油菜中的研究进展. 王会,刘佳,付丽,梅德圣. 2014
[20]五星黄鸡BMP15基因多态性与产蛋性能关联性分析. 凡文磊,刘红举,郑麦青,刘冉冉,李庆贺,文杰,赵桂苹. 2015
作者其他论文 更多>>
-
Transcriptome and 4D label-free quantitative phosphoproteome analyses reveal transcriptional and phosphorylation changes of key genes in fruiting body development of Pleurotus ostreatus
作者:何琪;降玉清;邬向丽;赵梦然
关键词:Pleurotus ostreatus; Transcriptomics; 4D label-free quantitative phosphoproteomics; Fruiting body development
-
基于大食物观的森林食用菌产业现状、问题与对策
作者:魏杰;曹子恒;黄晨阳
关键词:森林食用菌;森林食品;林下经济;林菇共育;菌根食用菌
-
一个影响糙皮侧耳生长发育的功能基因的发现与验证
作者:裴景琪;赵梦然;黄晨阳;邬向丽
关键词:糙皮侧耳;基因克隆;遗传转化;子实体发育
-
短柄白黄侧耳CCMSSC04611基因组特异性分析
作者:吴泽银;黄晨阳;赵梦然;张利姣;姚方杰
关键词:白黄侧耳;全基因组测序;功能注释;菌柄长度;比较基因组分析
-
糙皮侧耳乳酸脱氢酶对低温光照下菌丝生长的调控作用
作者:吴柏增;降玉清;何琪;黄晨阳;张利姣;赵梦然
关键词:糙皮侧耳;乳酸脱氢酶;乳酸;糖代谢;低温;光照
-
微生物对食用菌生长的影响及其相互作用研究进展
作者:崔嫚;邵改革;张瑞颖;杨诺林;田雨;王春霞;张庆桥;郑素月
关键词:食用菌;微生物;相互作用
-
白灵侧耳ACC基因克隆及表达分析
作者:田雨;郝刘斌;李海康;冯璠;王春霞;张瑞颖;郑素月
关键词:白灵侧耳;乙酰辅酶A羧化酶;基因克隆;系统发育;表达
