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白灵侧耳ACC基因克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 田雨;郝刘斌;李海康;冯璠;王春霞;张瑞颖;郑素月

作者机构：

关键词： 白灵侧耳;乙酰辅酶A羧化酶;基因克隆;系统发育;表达

期刊名称：食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2024 年 31 卷 05 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 通过克隆白灵侧耳（Pleurotus tuoliensis）乙酰辅酶A羧化酶（acetyl-CoA carboxylase, ACC）基因，采用生物信息学方法预测白灵侧耳ACC的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、三级结构和保守结构域；基于白灵侧耳ACC与灰盖鬼伞（Coprinopsis cinerea）、糙皮侧耳（P. ostreatus）、香菇（Lentinula edodes）、刺芹侧耳（P. eryngii）等16个物种的氨基酸序列，采用邻接法构建系统发育树；通过荧光定量PCR测定pH为3、4、5、6、7、8、9、10、11、12时的白灵侧耳ACC的相对表达量。结果表明：白灵侧耳ACC DNA长度为7 366 bp，包含12个内含子和13个外显子，cDNA长度为6 696 bp，共编码2 231个氨基酸残基，相对分子质量为247 400，白灵侧耳ACC为酸性、不稳定的亲水蛋白质，不具有信号肽和跨膜结构域，可能存在于细胞质、细胞核或过氧化物酶体中，主要由α螺旋、无规卷曲、β折叠和β转角组成，含有ACC中心区、生物素羧化酶、生物素羧基载体蛋白质和羧基转移酶4个保守结构域；系统发育树表明，白灵侧耳ACC的氨基酸序列与担子菌中的刺芹侧耳相似度较高；与对照组（pH5.42）相比，pH为6、7、8、9、10、11时，ACC相对表达量显著增加（P<0.05）。

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