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牦牛BTG2基因CDS区克隆分析及组织表达研究

文献类型： 中文期刊

作者： 申金伟;赵雪;路建卫;扎老;杨树猛;梁春年;成述儒

作者机构：

关键词： 美仁牦牛;BTG2基因;生物信息学分析;组织表达分析;系统进化

期刊名称：西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-9387

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】克隆牦牛BTG2基因编码区(CDS区),对其进行生物信息学分析和组织表达分析,为后续深入研究牦牛BTG2基因的生物学功能奠定基础。【方法】以美仁牦牛为研究对象,采集其心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织。提取脂肪组织总RNA,反转录获得c DNA。PCR克隆牦牛BTG2基因的CDS区,测序后进行生物信息学分析。利用RT-q PCR技术,分析BTG2基因在心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中的表达水平。【结果】牦牛BTG2基因的CDS区全长453 bp,共编码150个氨基酸;BTG2蛋白的分子式为C748H1190N208O213S8,分子质量为16 761.42 ku,原子总数为2 367个;不稳定性指数为48.51,是不稳定蛋白;理论等电点为9.14;主要分布于细胞核(占56.5%)和线粒体(占26.1%);氨基酸序列的1～108位有1个BTG1域;总平均亲水系数为-0.123,是亲水蛋白;共有15个磷酸化位点;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;无跨膜结构且无信号肽区域;与10个蛋白存在互作关系。系统进化分析结果 显示,美仁牦牛与野牦牛亲缘关系最近,与间蜂猴亲缘关系最远。RT-q PCR结果显示,BTG2在成年公牦牛的心脏、肝脏、脾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中均有表达,其中在脂肪组织和脾脏组织中表达水平较高,在肌肉和睾丸组织中表达水平较低。【结论】克隆了牦牛BTG2基因,对其进行了生物信息学分析,明确了其组织表达情况。

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