基于MEAN深度学习模型优化抗牛IFN-γ单抗亲和力
文献类型: 中文期刊
作者: 谢莹影;葛家振;刘新苗;曹漪丹;郭双双;王梓晴;宋国栋;刘一健;宋银娟;杨艳霞;陈胜利;郑福英;孙坚;储岳峰
作者机构:
关键词: 牛干扰素γ;牛结核病诊断;抗体优化;多通道等变注意网络
期刊名称:中国兽医科学
ISSN: 1673-4696
年卷期: 2026 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)
摘要: 旨在利用多通道等变注意网络(MEAN)深度学习模型,以提高作为牛结核病诊断的金标准之一的干扰素-γ(IFN-γ)释放试验的原材料——抗IFN-γ单抗的亲和力,以抗牛IFN-γ单克隆抗体3D2与抗原的复合物结构,对抗体互补决定区(CDR)进行序列-结构的协同进化,筛选获得高亲和力单抗突变体evo3D2,采用计算模拟分析结合自由能变化,并通过Western-blot、间接ELISA及间接竞争ELISA试验系统评估其结合性能。计算模拟显示,evo3D2通过重塑界面氢键网络及盐桥作用,使结合自由能降低4.73 kcal/mol。结果显示,evo3D2展现出优异的结合性能:在Western-blot检测中,其在1∶96 000的极高稀释倍数下仍能维持清晰信号,显著优于亲本抗体;间接ELISA测定其解离常数Kd为2.04 nmol/L,较亲本的解离常数6.09 nmol/L提升了约3倍;间接竞争ELISA显示其IC50从70.78 ng/mL降至34.88 ng/mL,进一步证实了亲和力的显著增强。结果表明,成功开发了高亲和力的牛结核病诊断候选抗体,并确立了基于MEAN深度学习模型在抗体工程中的应用潜力。
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