文献类型： 中文期刊
作者： 陈世钰;崔帅;蒋亚君;鑫婷;王洋;郝玉欣;黄建新;郭晓宇;朱鸿飞;吴佳俊;贾红
作者机构：
关键词： 非洲猪瘟病毒（ASFV）;lncRNA;Toll样受体信号通路;lncRNA-mRNA调控网络
期刊名称：中国畜牧兽医
ISSN： 1671-7236
年卷期： 2022 年 49.0 卷 07 期
页码：
收录情况： 北大核心（2020版） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）
摘要： 【目的】丰富非洲猪瘟病毒（African swine fever virus, ASFV）感染后猪外周血淋巴细胞长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）表达谱，并进一步挖掘影响Toll样受体信号通路的调控网络。【方法】试验动物感染ASFV,于第7天采集外周血并分离得到外周血淋巴细胞，运用Illumina高通量组学测序对外周血淋巴细胞中lncRNA进行测序，原始数据经处理后筛选获得差异表达的lncRNA,并进行靶基因预测，利用生物信息学方法对靶基因进行GO功能和KEGG信号通路富集分析，初步绘制与Toll样受体信号通路相关的lncRNA-mRNA调控网络，并对lncRNA-ENSSSCG00000041959在内的4个lncRNAs进行实时荧光定量RT-PCR验证。【结果】共筛选到73个差异表达的lncRNAs,其中上调表达lncRNAs 38个，下调表达lncRNAs 35个。GO功能分析结果显示，靶基因显著富集在调节免疫系统过程、防御反应、生物刺激、病毒反应和先天性免疫；KEGG信号通路富集分析显示，大部分靶基因与细胞循环、疾病及免疫应答有关，其中免疫相关信号通路有Toll样受体信号通路、TNF信号通路、产生IgA的肠道免疫网络等。进一步挖掘出lncRNA-ENSSSCG00000041959-RIPK1和lncRNA-ENSSSCG00000041959-IRAK1可能是影响Toll样受体信号通路的重要调控网络，实时荧光定量RT-PCR与测序结果一致。【结论】本研究初步鉴定出lncRNA-ENSSSCG00000041959-RIPK1和lncRNA-ENSSSCG00000041959-IRAK1可能是影响Toll样受体信号通路的lncRNA-mRNA调控网络，为进一步探索lncRNA调控ASFV感染机体免疫反应奠定了理论基础。
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