烟草SAUR基因家族鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 吴孟婷;籍燕;周东新;刘国祥;燕思凡;李媛;宁扬;林天然;李洋洋;张兴伟;程崖芝
作者机构:
关键词: 烟草;SAUR;生物信息学;进化分析;表达分析
期刊名称:中国烟草科学
ISSN: 1007-5119
年卷期: 2024 年 45 卷 6 期
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 为明确SAUR基因家族在植物生长发育和胁迫响应中的分子生物学机制,利用生物信息学手段,鉴定了烟草SAUR家族基因,分析了其进化关系、理化性质、基因及蛋白结构、启动子元件、染色体分布和叶片表达模式等。结果表明,在烟草中共鉴定出137个NtSAUR基因,分布在23条染色体上,分为4个亚族;仅4个基因含内含子,同一分支成员蛋白序列高度保守;NtSAUR启动子存在植物生长发育、环境胁迫、激素及光响应4类顺式作用元件;烟草SAUR基因在进化过程中可能发生大量的串联复制和染色体片段性复制;基于叶片表达模式分析,筛选到2个可能参与烟草叶片形态建成的基因和6个可能调控叶片衰老的基因。以上研究结果将为下一步烟草SAUR基因功能验证提供理论依据。
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