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2株海鸭源H3亚型禽流感病毒全基因组分子特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 谢守玉;王睿敏;崔鹏飞;施开创;韦显凯;冯淑萍;龙凤;屈素洁;陆文俊;黄金山;黄凤梅;温新瑞;尹彦文;邓国华

作者机构：

关键词： 海鸭;H3亚型禽流感病毒;遗传进化

期刊名称：中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2023 年 50 卷 04 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】了解广西沿海地区水禽H3亚型禽流感病毒的基因组分子特征。【方法】本研究通过RT-PCR一步法分段扩增法，对2020年从广西沿海地区分离到的2株海鸭源H3亚型禽流感病毒A/duck/Guangxi/S11359/2020（H3N1）与A/duck/Guangxi/S11374/2020（H3N8）进行全基因组测序与进化分析。【结果】2株H3亚型禽流感病毒的HA蛋白裂解位点序列均为340PEKQTR↓GLFG349,为低致病性禽流感病毒的分子特征，与受体嗜性关联的第226、228位氨基酸均为Q和T,可能仍主要结合禽类受体；BLAST分析结果显示，本研究H3N1亚型禽流感病毒的M、NP基因及H3N8亚型禽流感病毒的PA基因，与H7亚型禽流感病毒相似性最高，分别为99.5%、98.7%和98.9%,表明H3可能与H7亚型禽流感病毒发生了基因交换；2株H3亚型禽流感病毒与越南、孟加拉国、韩国等周边国家水禽源的H3、H4、H6、H7、H9等亚型相似性较高，可能拥有相同的进化来源；遗传进化分析表明，H3亚型禽流感病毒各基因进化分支均属于欧亚谱系，与水禽源毒株遗传距离较近，犬源、猫源的毒株次之，人源、猪源的毒株较远，但H3N1亚型禽流感病毒的NS基因与日本早期人源流感毒株A/Aichi/2/1968遗传关系最近，可能发生了基因置换。H3N8亚型禽流感病毒的HA基因检测有重组信号，重组的亲本毒株分别为A/duck/Beijing/40/04（相似性为93.1%）和A/canine/Beijing/20121215-34/2012（相似性为97.1%）。【结论】广西沿海地区的2株H3亚型禽流感病毒基因来源复杂，表现出遗传多样性特征。

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