数字农科院2.0

梅花鹿鹿茸全长转录组测序及鹿茸产量相关基因的挖掘

文献类型： 中文期刊

作者： 闵祥玉;卫佳丽;许彪;刘汇涛;郑军军;王桂武

作者机构：

关键词： 梅花鹿鹿茸;全长转录组测序;产茸性状;功能基因;差异分析

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2024 年 55 卷 12 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 旨在获得梅花鹿鹿茸组织全长转录本和结构信息，并进一步挖掘出影响梅花鹿鹿茸产量的功能基因。本研究采取饲养管理条件一致的6头2锯龄健康雄性东大梅花鹿，取其相同部位鹿茸组织。根据茸重将鹿茸分为高、低产两组，每组3个重复。利用PacBio Sequel平台以及Illumina平台分别对高、低产鹿茸混合样品进行全长转录组测序。结合高、低产两组二代测序技术，使用SUPPA、KOBOS-I、Cytoscape等工具对可变剪接、功能富集及Hub基因等预测分析。高、低产组测序分别获得有效插入片段36 074 385 bp和32 413 962 bp;转录因子注释显示高产组中bHLH家族转录本数量要高于TF＿bZIP家族，低产组中则相反。高产鹿茸组共存在6 644个可变剪接事件，而低产鹿茸组则为7 626个可变剪接事件；经比对，COL1A1在多个融合基因中起主效作用；两组样品中共筛选出207个差异表达基因，KEGG富集显示差异表达基因主要集中在甲状旁腺激素的合成、分泌以及胆固醇代谢等通路；鉴定到11个Hub基因，分别是APOB、SH3GL2、SYT1、ANGPTL4、FGF21、CACNA1E、SERPI...

分类号：

  • 相关文献

[1]塔里木马鹿单倍型特性及其与产茸性状的关系. 苏莹,鞠贵春,邵元臣,刘松啸,周盼伊,邢秀梅. 2016

[2]煮炸和冷冻干燥对鹿茸中脂溶性成分及色差的影响. 侯召华,刘畅,任贵兴. 2017

[3]基于灰色关联度法评价梅花鹿鹿茸品质. 黄胜广,毕融冰,赵卉,金美伶,金春爱,张秀莲,王峰. 2020

[4]吉林省梅花鹿鲜茸重与茸尺性状的关联分析. 田雪琪,刘汇涛,房瑞新,范欢欢,李洋,邢秀梅. 2021

[5]橘全爪螨不同品系γ氨基丁酸受体基因差异性分析. 张云飞,李晓娇,岳建苏,江高飞,冉春. 2012

[6]耕地格局时空动态变化过程和差异分析--以浙江安吉为例. 陈学渊,唐华俊,吴永常,周清波,崔健. 2015

[7]国内外地下水硝酸盐污染及其防治差异分析. 吴雨华. 2011

[8]耕地格局时空动态变化过程和差异分析——以浙江安吉为例. 陈学渊,唐华俊,吴永常,周清波,崔健. 2015

[9]玉米种质籽粒铁含量的测定及差异分析. 陈洁,潘光堂,李华雄,杨克诚,王康宁,谢传晓,张世煌,张谦. 2007

[10]中国和国际豌豆核心种质群体结构与遗传多样性差异分析. 宗绪晓,关建平,顾竟,王海飞,马钰. 2009

[11]5个品种牛骨的营养组成及其含量差异分析. 吴婷,贾伟,管声,尉莹,刘文媛,张春晖,李侠,余群力,韩玲. 2017

[12]海拔高度对喀什地方鸡外观性状、体尺性状及羽毛结构的影响. 张华,韩建林,王玉涛. 2023

[13]基于GC-MS的不同产地铁皮石斛代谢物差异分析. 李紫曦,牟美睿,杨仁杰,刘海学. 2022

[14]基于气相色谱-嗅闻-静电场轨道阱高分辨质谱法探究常见禽蛋气味化合物差异. 高薛,邢维海,余雅男,张军民,杨悠悠,曹日亮. 2025

[15]国际食品法典新鲜水果和蔬菜委员会标准跟踪比对研究. 陈云霞,李书宇,万靓军,秦琳,吕军,路馨丹,徐东辉. 2025

[16]桃主要性状的分子标记与功能基因定位研究进展. 连晓东,谭彬,郑先波,陈谭星,王婷,栗焕楠,冯建灿. 2018

[17]利用产量功能基因标记分析三系杂交水稻亲本的遗传多样性. 杨蛟,蒋开锋,曹应江,杨莉,杨乾华,万先齐,游书梅,罗婧,高磊,李昭祥,郑家奎. 2014

[18]棉花纤维品质相关基因挖掘及功能基因研究进展. 肖水平,宋国立,余进祥. 2020

[19]基因芯片技术及其在寄生虫学研究中的应用. 杨健美,冯新港,林矫矫. 2011

[20]植物诱导抗病基因工程育种研究进展. 宋二玲,邹修平,刘琦琦,陈善春. 2012

作者其他论文 更多>>