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梅花鹿MSRB3基因多态性及其与茸重性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周雅;张禾垟;刘琳玲;李浩东;郑军军;王桂武

作者机构：

关键词： 梅花鹿;MSRB3基因;SNPs;茸重

期刊名称：中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2022 年 11.0 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 科技核心（2021版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】本研究旨在探索梅花鹿甲硫氨酸亚砜还原酶B3（methionine sulfoxide reductase B3,MSRB3）基因多态性及其与茸重性状的关联性。【方法】选取高、低产茸量的梅花鹿各8只,应用DNA直接测序法检测基因变异位点。采用MassARRAY? SNP分型技术对314头24月龄梅花鹿MSRB3基因进行基因分型,并结合梅花鹿茸重性状数据进行了关联分析和单倍型分析。【结果】在梅花鹿MSRB3基因中共发现6个SNPs位点,其中2个SNPs位点位于外显子区域,且突变均未引起氨基酸改变,属于同义突变,其余4个SNPs位点均存在于内含子区域。分型结果显示4个样本未分型成功,其余310个样本进行后续分析。各位点观测杂合度和期望杂合度基本一致,g.44455582 T＞C、g.44455759 C＞T、g.44414424 T＞C、g.44350306 T＞C及g.44340836 G＞A等5个位点的杂合度较高,均属于中度多态（0.25＜PIC＜0.5）,g.44340734 G＞C位点杂合度较低,属于低度多态（PIC＜0.25）。卡方检验结果表明,g.44455759 C＞T位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态（P＜0.05）,其他5个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P＞0.05）。对6个SNPs位点的不同基因型与梅花鹿茸重的关联分析结果表明,g.44455582 T＞C位点的TT基因型个体茸重极显著高于CC和TC基因型（P＜0.01）。单倍型分析结果显示,g.44340734 G＞C和g.44350306 T＞C、g.44455582 T＞C和g.44455759 C＞T位点存在强连锁,各产生3种单倍型,在Block 2区块中单倍型TC茸重显著高于单倍型CT（P＜0.05）。【结论】MSRB3基因与梅花鹿茸重性状密切相关,g.44455582 T＞C位点和单倍型TC可作为筛选高产梅花鹿的分子标记。

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