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口蹄疫病毒AF72株3D聚合酶的三维结构模拟和功能分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张昱;王永录;张永光;潘丽;方玉珍;刘力宽;蒋守田;吕建亮;张中旺;张淑刚;李正丰;杜进鑫

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;3D聚合酶;三维结构;活性位点

期刊名称：中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2008 年 38 卷 10 期

页码： 842-846

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究口蹄疫病毒(FMDV)3D聚合酶的结构和功能,以A型FMDV AF72株RNA为模板,反转录并扩增目的基因,将PCR纯化产物与pGEM-T Easy载体连接并转化JM109菌株,对经凝胶电泳、PCR和EcoRⅠ酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序,并与GenBank中登录的其他4株FMDV完整参考序列进行比较,以确定AF72株3D聚合酶的核苷酸和氨基酸序列的保守区域,然后利用同源建模的方法建立AF72株3D聚合酶的三维结构。结果显示,3D聚合酶含有孔状活性区域。拉马钱德兰图证明,构建的3D聚合酶的空间结构是合理的。

分类号： S852.659.6

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