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口蹄疫病毒株AF72VP1的结构构建与B细胞表位预测

文献类型： 中文期刊

作者： 张昱;王永录;张永光;潘丽;方玉珍;刘力宽;蒋守田;吕建亮;张中旺;张淑刚;李正丰;杜进鑫

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;VP1结构蛋白;3D结构;B细胞表位

期刊名称：生物技术通报

ISSN：

年卷期： 2008 年 06 期

页码： 158-163

收录情况： CSCD

摘要： 以口蹄疫病毒株AF72RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEM-Teasy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和EcoRⅠ酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序。比对测序结果确定AF72VP1的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72VP1结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72VP1结构蛋白的B细胞抗原表位。结果显示,VP1结构蛋白呈现较规则的空间构象,其中5~11、24~30、43~47、82~87、132~147和196~203氨基酸区段是AF72VP1结构蛋白可能的B细胞抗原表位区域,该结果将...

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