天津地区猪繁殖与呼吸综合征流行毒株ORF5基因的克隆及遗传变异分析
文献类型: 中文期刊
作者: 李文忠;荣新利;刘野;吴庆东;张乐;孙英峰;于海
作者机构:
关键词: 猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒;ORF5基因;序列分析;遗传变异;同源性分析
期刊名称:中国动物传染病学报
ISSN: 1674-6422
年卷期: 2023 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; ; 科技核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 为了解天津地区猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)的流行和遗传变异情况,收集2021—2022年天津地区养殖场209份临床疑似发病猪的组织进行检测及ORF5遗传变异分析。结果表明:PRRSV阳性样品总检出率为37.3%(78/209),并从阳性样本中选择15个不同地区来源具有代表性样品进行ORF5基因克隆序列。序列及遗传进化分析显示,该15株PRRSV毒株均属于美洲型,其中8条PRRSV毒株的ORF5基因与以HuN4为代表的类HP-PRRSV毒株同源性较高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为89.4%-97.3%和80.6%-95.5%,而与NADC30、VR2332、NADC34等毒株的同源性较低,分别为77.1%-87.1%和77.1%-86.6%;6条PRRSV毒株的ORF5基因与以NADC30为代表的类NADC30毒株同源性最高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为91.9%-92.7%和91.5%-93.0%,而与HuN4、VR2332、NADC34等毒株的同源性较低,分别为83.6%-87.8%和79.6%-86.6%;1条PRRSV毒株的ORF5基因与以NADC34为代表的类NADC34 毒株同源性最高,核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性为96.4%和95.5%,而与NADC30、HuN4、VR2332等毒株的同源性为86.7%-89.9%和86.6%-92.0%。结果表明,2021—2022年天津地区以类HP-PRRSV、类NADC30 PRRSV为主要流行毒株,同时出现类NADC34毒株的流行,存在明显的遗传多样性。研究结果可为天津地区PRRS的防控提供理论依据。
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