H3亚型犬流感病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立
文献类型: 中文期刊
作者: 吴颖;王福军;王秀荣;施建忠;杨焕良;邓国华;陈艳;陈化兰;刘丽玲
作者机构:
关键词: H3亚型犬流感病毒 ; TaqMan MGB探针 ; 荧光定量RT-PCR
期刊名称:中国预防兽医学报
ISSN: 1008-0589
年卷期: 2021 年 43.0 卷 7.0 期
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2020-2021年度) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)
摘要: 为建立H3亚型犬流感病毒(CIV)荧光定量PCR检测方法,本研究根据H3亚型CIV HA基因的保守区序列,设计合成一对特异性引物和TaqMan MGB探针,经条件优化后初步建立了H3亚型CIV荧光定量RT-PCR检测方法.结果显示,构建的重组质粒标准品在109拷贝/μL~102拷贝/μL浓度范围内有良好的线性关系,标准曲线的相关系数为0.999.该方法仅能特异性扩增H3N2亚型CIV核酸,与H3N2亚型禽流感病毒、人流感病毒和猪流感病毒及H9N2亚型CIV、H1N1亚型猪流感病毒、犬腺病毒、犬瘟热病毒、犬细小病毒、犬冠状病毒等病毒核酸均无交叉反应.该方法最低可检测到的质粒标准品浓度为19拷贝/μL,敏感性高于普通PCR方法.组内与组间重复性试验的变异系数均小于1%.利用该方法对83份临床样品的核酸进行检测,检测结果与病毒分离结果总符合率为97.59%.本研究建立的荧光定量PCR检测方法特异性强、敏感性高、重复性好、操作简便,为临床H3亚型CIV的快速检测提供可靠方法.
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