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绿色轻简超级稻遗传解析与分...

绿色轻简超级稻遗传解析与分子育种团队定位应用基础研究与科技基础性工作。根据我国,特别是华南地区对优质、高产、高效、适宜轻简化栽培绿色超级稻新品种培育的重大战略需求,挖掘种质资源的优质、高产、抗病、抗逆、氮高效和易直播等性状的重要优异基因,解析华南稻区优异品种演变规律和挖掘重要受选择区段内的优异基因,建立预测未来优异品种、骨干亲本和杂种优势的技术方法及设计育种的技术体系,建立一套适合种质资源评价的DNA指纹鉴定体系,为培育优质、高产、抗逆、适宜轻简化栽培新品种提供技术支撑,选育绿色轻简水稻新品种和实现新品种产业化。

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猪基因组设计育种

猪基因组设计育种创新团队专注于功能基因组与基因组设计育种相关研究。主要包括:综合利用高通量的基因组、转录组、代谢组、蛋白组等多种组学技术和精准基因编辑技术,解析猪和小鼠等动物组织器官生长发育、产肉性状、营养利用和抗病等重要经济性状形成的分子机制;利用生物信息、分子和细胞生物学等手段,在分子、细胞和个体水平,阐明基因和非编码RNA的功能和表达调控机制;整合多组学数据和全基因组关联分析,大规模挖掘猪等动物经济性状关键基因和新的遗传标记;开发猪全基因组设计育种的新理论新方法,开展猪育种新材料创制和品种改良。

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农业宏基因组学

本创新团队立足于聚焦于目前宏基因组组装中的瓶颈问题,开展复杂环境DNA样本提取,和利用三代测序构建完整基因集以及高效的物种和功能分类算法,从方法学上为广大复杂微生物群落的高质量宏基因组组装探明道路,为畜禽肠道宏基因组与绿色健康养殖技术研究提供基础实现基因组学,实现生物信息学和计算机科学等学科的交叉融合。

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经济作物的全基因组设计育种

团队致力于研究蔬菜和马铃薯基因组设计育种理论与技术,利用组学大数据开拓植物生物学前沿并推动蔬菜作物育种变革。主要研究内容包括蔬菜驯化的遗传基础、调控蔬菜品质的分子机制、马铃薯和蔬菜分子设计育种。主导和参与的黄瓜、番茄、马铃薯等重要蔬菜作物的基因组、变异组和代谢组学研究,是国际蔬菜基因组研究领域的领跑者。

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农业生物转录组与代谢组学

团队聚焦植物活性天然产物的高效发现、机制解析、定向设计和合成生物学制造,围绕茉莉素和紫杉醇等重要天然产物,解析生物合成与调控途径,开发代谢组学等指导的元件挖掘与线路设计方法,探究外源途径对于植物底盘的适配性原则,开发植物底盘代谢网络重编程技术,发展植物合成生物学底盘构建技术等,建成国际领先的农业合成生物学科研团队。

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动物功能基因组学

团队围绕我国农业畜禽种源的关键核心问题,针对畜禽品种生产性能低下、抗病力差等现状,以高通量多组学、基因编辑和基因组选择等技术为基础,开展动物发育过程中动态三维转录调控网络的构建,研发和改进三维基因组学关键技术及生物信息学算法开发,挖掘我国优质畜牧种质资源,开发新型育种技术,加速种质创新。

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作物组学大数据与应用

团队围绕国家种业发展的重大需求,以种质资源引进与利用为目标,全面收集国内外小麦、碗豆等麦豆作物种质资源,开展种质资源适应性调查和遗传变异图谱绘制,聚焦氮高效利用、高光效等高效能性状,筛选优异种质资源,解析高效性状的形成机理,并在此基础上构建全基因组设计育种流程,创制新的优异种质资源,建成国内领先的粮豆作物遗传资源挖掘与利用创新团队。

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农业基因组学技术研发与应用

团队围绕农业基因组学技术研发与应用目标,瞄准农业组学发展面临的重要科学问题,开展序列组装算法、变异检测算法、注释体系算法等组学基本算法的开发,同时发展单细胞组学、代谢组学等多组学拓展算法的开发,将技术应用于农业基因组和育种研究中,进一步开拓重要农作物表型组学研究,建立表型数据集,全面布局农业组学研发与应用,打通基因组学与表型组学的壁垒,为组学大数据的深入利用提供支撑。

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农业昆虫基因组学

团队以基因组学和基因编辑技术为主要支撑,结合遗传学、生态学、细胞学、分子生物学的前沿技术,解析重要农业害虫的环境适应性机制,开展外来生物入侵机制、农业病原微生物致病机制等研究,开发绿色防控新技术,增强国家粮食安全,生态安全。

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超级稻种质创新

团队主要开展系统创制和构建优良水稻种质资源和遗传材料研究,利用基因组学技术克隆控制水稻重要农艺性状的关键基因,通过分子设计培育优良的超级稻品种。在水稻种质资源研究领域达到国际一流、国内领先水平;在水稻多组学及水稻发育生物学研究领域、丰富水稻重要器官或组织发育理论达到国内领先水平。

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动物表观基因组学

动物表观基因组学团队主要研究动物表观基因组学新方法开发,哺乳动物基因编辑方法优化;营养与菌群的表观遗传效应;构建包括小鼠、猪等哺乳动物的疾病模型,研究动物发育和疾病过程的表观遗传调控表观遗传调控。针对微量细胞的全基因组甲基化测序技术,建立了一种名为GOTI的新型脱靶检测技术,显著提高基因编辑技术的脱靶检测灵敏性。同时团队与国内外多个学校合作,在营养、肠道菌群对仔猪肠道发育的表观遗传效应,哺乳动物基因组编辑等方面进行深入研究。

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